谈到股份的问题，马云的态度很明确：阿里巴巴不允许任何人控股，在阿里巴巴，投资者只是娘舅，创业者才是企业的主人。马云相信，虽然资本的力量是强大的，但是也不至于强大到无可战胜、不可抗拒的地步。因为，比资本更强大的是利用资本的人的力量，执行资本意志的团队的力量。
【创业大讲堂——创业团队永远是企业的主人】
1999年的夏天，创业几个月后，有了一定名气的阿里巴巴很快就面临到资金的瓶颈：公司账上没钱了。马云后来表示，他希望阿里巴巴的第一笔风险投资除了带来钱以外，还能带来更多的非资金要素，例如进一步的风险投资和其他的海外资源。而被拒绝的这些投资者，并不能给他带来这些。
就在这个时候，瑞典著名投资公司InvestorAB派副总裁蔡崇信到杭州考察阿里巴巴。短短几天，蔡先生告诉马云想加入阿里巴巴。他的决定轰动了InvestorAB高层，他们凭借与蔡先生多年共事的经验确信阿里巴巴是一个值得投资的公司。蔡先生的加盟在投资银行界产生了连锁反应。华尔街投资公司高盛打破惯例，牵头对阿里巴巴进行第一轮投资。而在此之前，这家公司从不投第一轮，更不在第一轮中占大股。阿里巴巴第一轮融资在1999年10月以大团圆结局划上圆满句号，为阿里巴巴解了燃眉之急。以高盛为主的一批投资银行向阿里巴巴投资了500万美元，这一笔所谓的“天使基金”让马云喘了口气。
更让他预料不到的是，更大的投资者也注意到了他和阿里巴巴。1999年秋，日本软银的总裁孙正义约见了马云。一见面孙正义就直奔主题：“我们要投资，我们要占30%的股份。”
马云当即提出了自己的三个条件：一是希望孙正义本人亲自做这个项目；二是希望用软银自己的资金；三是价格问题。对于这三个问题，孙正义的回复是：“我从来不做任何公司的董事，我就做你的顾问吧；我也可以将我自己的基金给你；至于价格我们现在就开始商量。”
2000年1月，马云和蔡祟信在跟孙正义经过三次较量之后，终于谈妥了价钱——3 000万美元，占30%的股份。孙正义也总算“了却了一桩心事”，这大概也是这位在业界素有“网络风向标”之雅称的日本大“财主”所经历的最艰难的谈判了。
但是，孙正义很快就发现自己高兴得太早了。几天之后，就在软银和阿里巴巴正式签约之前的最后几天里。孙正义最担心的事情还是发生了——马云又“兴风作浪”了。问题还是出现在融资额上，在这3 000万美元上。更令人吃惊的是，马云“变卦”的原因不是因为觉得孙正义给的钱太少了，相反，恰恰是嫌这3 000万太多了。他声称：“钱太多了，我不能要。”这是让人们大呼傻瓜的事：同样的投资比例，马云不要3 000万美元，只要2 000万美元！
“疯子”马云真的“犯傻”了吗，他葫芦里又卖的什么药呢？为了理解其中的缘由，我们要必要理清一下融资前后的一些来龙去脉。
与孙正义在东京初步谈妥了之后，马云便和蔡崇信很快回到杭州。随即，阿里巴巴召开了一次董事会，会上马云宣布了东京谈判的初步结果以及和软银正式合作的具体事宜。经过一番激烈的讨论之后，董事们一致认为：如果按孙正义的开价，软银占有的股份过多了，这将导致股东结构的不平衡。
中国有太多企业因为强调控股权与控制权，最终陷入利益争斗，影响了公司发展。事实上，马云也有过这方面的教训。在创立阿里巴巴之前，马云曾创立过一家“中国黄页”的公司。其中，杭州电信控股70%，以马云为首的创始人团队持股30%。由于马云在股权上的弱势，他们在董事会上的意见总是会被另一方反对，但对方又总提不出可执行的意见，结果马云什么也干不成。因此，“中国黄页”总是停留在原来的层面上得不到发展，最后被后起的竞争对手超越。
说到股东结构的问题，我们有必要再次提到马云一贯坚持的原则：不允许任何机构和自然人控股阿里巴巴。如果现在就给了孙正义那么多股份，将来再融资，吸收新股东就很成问题，很可能出现股权过于集中的尴尬。所以，听了董事们的一番高见，马云自己似乎也“刚回过神”来了——“太愚蠢了，我拿那么多钱干什么！”
董事会结束之后，马云立即打电话跟孙正义的助手说了自己的想法。于是，才跟孙正义东京刚刚“交火”几天的工夫，马云又与这位助手开始了激烈的“过招”：马云说得很直白：“我们只需要足够的钱，太多的钱会坏了事。”听到马云这番“无稽之谈”，孙正义的助手立刻跳了起来，“简直不可思议，我们软银的钱你竟然嫌多，你这是在赌博，这是不可能谈下去的！”
马云说：“是的，我在赌博，但我只赌自己有把握的事。尽管我以前控制的团队不超过60人，掌握的钱最多200万美元，但2 000万美元我管得了，太多的钱就失去了价值，对企业是不利的，所以我不得不反悔。”……
谈判陷入僵局，然而马云仍然坚持自己的主张——“只要2 000万”。
在暴跳如雷的孙正义助手面前，马云给孙正义发了一个电子邮件，他说：“……希望与孙正义先生手牵手同闯荡互联网……如果没有缘分合作，那么还会是很好的朋友。”过了5分钟，孙正义回复邮件：“谢谢您给了我一个商业机会。我们一定会把阿里巴巴名扬世界，变成雅虎一样的网站。”
就这样，一向在风险投资界呼风唤雨的孙正义，这回却向阿里巴巴和马云妥协了，他答应马云提出的全部条件。马云最终确定了2 000万美元的软银投资，阿里巴巴管理团队仍绝对控股。两次讨价还价，均以马云的完胜而鸣金收兵。
这次融资之后，马云总结经验教训，颇有心得，他告诫创业者，要在公司最好的时候去融资，不要被资本控制。在公司最好的时候去融资，你就会有更多的回旋余地。
曾有分析说，这次2 000万美元的融资对于阿里巴巴来说，并非最明智的选择。因为阿里巴巴当时刚获得高盛大额投资，略显富余，并且当时阿里巴巴的日流量与知名度都在与日俱增，再晚一些引入新的投资者，显然更有利于公司总值的增加。然而，因为欣赏孙正义而甘愿吃点小亏的马云却因此走了大运。从2000年4月起，纳斯达克指数开始暴跌并持续了长达两年的低迷不振状态，这之后所有中国互联网公司都无法得到任何投资，唯马云和他的阿里巴巴粮草充足，衣食无忧。
后来马云在谈到与孙正义的合作时说：我很荣幸有缘与孙正义先生握手。若是没有这次握手，阿里巴巴和淘宝网的事业不会像今天这样顺利展开，尤其是在我收购雅虎中国的行动中。
从投资阿里巴巴至今，孙正义一直十分信任我，几乎完全没有干预过企业的相关事务。他和我的理念一样，就是要赢在未来，对阿里巴巴作长期的战略考虑。我常在电话中和他开玩笑，阿里巴巴如果缺钱，我第一个电话肯定打给你。他说，你当然应该打给我啊。
没想到这样的玩笑却在现实中得到了解释。在我收购雅虎中国的过程中，他主动让出了3.5亿美元的股份。
2003年初，马云、蔡崇信与孙正义就软银向阿里巴巴“加码”事宜进行正式谈判。
此时，阿里巴巴和软银已经合作了三年多，这三年经历了互联网的癫狂、寒冬、复苏，但以马云为首的阿里巴巴团队和以孙正义为首的软银股东之间的合作还是比较顺利的，即便在互联网最低谷的时期，孙正义和马云之间也是互不“骚扰”，可谓风雨同舟。
尽管如此，再次到了谈判桌前，双方“剑拔弩张”之势还是不减当年。与第一次谈判一样，阿里巴巴出席的又只有两个人：马云和蔡崇信，而软银方面出席的又是一长排人，同样除了孙正义以外，软银方面所有其他的人还是不发言的。
双方争论的焦点主要在两个地方，一是孙正义在投入巨资之后是不是控股的问题，一个是阿里巴巴员工团队的持股问题。
前一个问题相对好解决，因为有两个因素可以调节，一个是资金，一个是股份。但对孙正义来说，员工团队持股问题不好理解。因为在日本所有的公司的员工很少有持股的前例，而马云则坚持必须通过股份来激励整个公司团队。在这两个问题上双方相持不下，一时间场内的气氛陷入僵局。
