于是忒修斯成了雅典的国王。在他执政之前，阿提喀地区的居民大多居住在雅典小城和周围散布的村落里。忒修斯让居民向城里集中，并把零星的村庄组织起来，加强城市与乡村的分工和联系。又把治下的居民分为贵族、农民和手工业者三大阶级，规定各阶级的权利和义务。又取消了各个市镇的小议会，代之以规模更大、更有组织的雅典市议会。
为了达到这些目标，他亲自去各个村镇解释，这么做对大家都是有利的。改革能给贵族带来利益，因此贵族欢迎；于是大势所趋，守旧、模棱两可的人、贫民和低贱的人也就都没有意见了。忒修斯的执政能保障所有居民能公平地获得权利，因此吸引来许多新的移民。这样雅典成为一个自由、开放、强大的城市。
忒修斯又宣布限制国王的权力，让国王的权力受到贵族议会和人民会议的节制，他说：“我只愿在战争时当你们的首领，平时更愿做一个遵守法律的人。”雅典因而制订了一部宪法，以保障雅典自由、民主的社会秩序。
他又要求雅典人敬畏神灵，把雅典娜女神作为雅典的保护神。他还定了一个假日，称为泛雅典节，即全体雅典人的共同节日；又在哥林多地峡举行角力赛会。雅典由此发展成为一个强大的城市。
忒修斯为公众作的贡献，远远超过了他所崇拜的赫拉克勒斯。
3后期故事
当他把这一切完成，年纪就已经很大了。在这漫长的时间里，王后希波吕忒死于外族的攻击。忒修斯当年跟伊阿宋冒险经过阿宗玛妇人国时，希波吕忒作为使者来到他们的船上，被忒修斯带回雅典，她后来生的儿子叫希波吕托斯。阿宗玛人却认为她是被拐骗走的，于是有一天她们登陆并攻进雅典城，但激战之后未能取胜，与雅典缔结了和约离去。希波吕忒在与忒修斯共同战斗时阵亡，雅典人立了一根大石柱纪念她。
忒修斯在晚年交了一个年轻的朋友，叫庇里托俄斯，是伊克西翁的儿子。他听说忒修斯身强力壮，人人敬仰，就全副武装，牵走忒修斯的牛。忒修斯也全副武装地去追他。当庇里托俄斯看到追来的忒修斯时，很钦佩他，放下武器甘愿受惩。然而忒修斯也被他所吸引，对他说：“做我的朋友和战友吧！”两人成为朋友，相互立誓，永远忠于友谊。后来庇里托俄斯请忒修斯参加他的婚礼，新娘是帖撒利地区的拉庇泰族人。拉庇泰人是最先驯服马匹的人类。参加婚礼的还有陶洛斯人。陶洛斯人被称为“云雾的子孙”，本与拉庇泰族有仇，但因为是庇里托俄斯的亲戚，所以也参加了婚礼。婚礼中，陶洛斯人欧律提翁饮酒过多，突然抓住新娘，要把新娘拖走，紧接着其他的陶洛斯人也学着抢参加婚礼的女人。客厅变成了战场。血战之后，庇里托俄斯才稳稳地保护了他的新娘。他们与拉庇泰族的战争就此展开，直到他们被完全征服。庇里托俄斯与忒修斯的友谊也更加坚固。
婚礼大战取胜后不久，忒修斯去克里特娶阿里阿德涅的妹妹淮德拉。淮德拉也早就从雅典回到了故乡克里特，跟国王哥哥丢卡利翁在一起。克里特的老国王弥诺斯去世后，儿子丢卡利翁成为新国王，对忒修斯产生了好感，与他结成了攻守同盟。忒修斯自从希波吕忒死后一直未娶，听说淮德拉长得妩媚动人，请求丢卡利翁将妹妹淮德拉嫁给自己为妻，丢卡利翁答应了他。淮德拉长得像她的姐姐，这令忒修斯很欣慰。淮德拉生了两个儿子，阿卡玛斯和得摩丰。
忒修斯的长子希波吕托斯早年在祖母埃特拉的兄弟们那儿接受教育，现在他回到雅典。当淮德拉第一次看见他时，就爱上了他，他们两人也正好同岁。那次淮德拉还以为面前站着的是年轻时的忒修斯。但希波吕托斯已经把自己献给了处女神阿耳忒弥斯，发誓永不结婚。淮德拉在雅典卫城建了一座神庙，以向爱情女神祈祷，又常躲在桃金娘树下悲叹自己的命运。后来，她向她的年老的乳母吐露了心事，乳母好心地把她的心事告诉希波吕托斯。希波吕托斯拒绝了，并从此尽量避开淮德拉。这时忒修斯去了特洛曾，回来后，他发现妻子淮德拉已自缢，留下遗书说：“希波吕托斯要对我无礼，我只好以死躲避，以免使国王名声有损！”
忒修斯看罢遗书，举双手向青天祈求：“父亲波塞冬啊，你说过会满足我三个愿望的，现在我只要满足一个愿望：今天就让这个儿子永远消失！”又将希波吕托斯叫到面前咒骂一番，然后将他驱逐。希波吕托斯只说句“我的良心是纯洁的，我没有做过任何坏事”后，就走了。傍晚，仆人告诉忒修斯希波吕托斯已经自杀。忒修斯听了举双手感谢诸神，然后问：“他是怎样死的？”使者告诉他，是跳海身亡，死前还重申了自己的清白。忒修斯听了，还不知道自己该喜还是该忧，他看着地板说：“但愿他还活着，那样我好问清他的罪过。”不一会儿，淮德拉的乳母因受不了良心的折磨，来见忒修斯，说出王后和儿子之间的事情。接着希波吕托斯被担架抬进来，还没断气，问他：“你是否还相信你儿子的无辜？”忒修斯点头。希波吕托斯又说：“父亲，我原谅你！”然后死了。忒修斯把儿子和淮德拉一起葬在了桃金娘树下。
4晚年
忒修斯老年怀念以前的冒险生活，而庇里托俄斯的妻子希波达弥亚在婚后不久就死了，他们两人就约定一起出去抢妻子。他们先去斯巴达，在阿耳忒弥斯神庙里劫走海伦，带到亚加狄亚的特格阿。海伦是斯巴达国王廷达瑞俄斯的女儿。两人通过抽签，确定忒修斯得到海伦。忒修斯把海伦交给母亲埃特拉后，与庇里托俄斯继续冒险，因为按照约定，他们还要抢一个美女给庇里托俄斯。这次他们遇到了灾难，只有忒修斯获救。传说他们抢夺的对象是冥王普路同的妻子珀耳塞福涅。
忒修斯在外遇险时，雅典城里，厄瑞克透斯的孙子梅纳斯透斯萌生了篡夺王位的念头。梅纳斯透斯向贵族演讲说，忒修斯让他们从乡村迁移到城市，是为了好控制他们；又向自由民演讲说，他们不应放弃乡间的神庙和神，而来服从一个外地的暴君。这时，海伦的两个哥哥卡斯托耳和波吕丢刻斯来到雅典，要求归还海伦。雅典人说不知道忒修斯把海伦藏在哪里。兄弟俩就以武力威胁。有个叫阿卡特摩斯的雅典人告诉兄弟俩：海伦藏在阿弗得纳。卡斯托耳和波吕丢刻斯于是去攻陷了阿弗得纳，然后带着海伦又回来攻雅典城，为的是要参加雅典人的一个宗教仪式。为了削弱忒修斯在公众中的影响，梅纳斯透斯劝公众友好地打开了城门。卡斯托耳和波吕丢刻斯于是进了雅典，没有伤害雅典人，举行仪式后，在雅典人的欢送下带着海伦回去了。
忒修斯回雅典后，变得严肃而沉默。听说海伦回家了，反而觉得如释重负。他想重新执政。但梅纳斯透斯得到贵族的支持，成立了一个帕拉斯党。他们自称帕拉斯党人，是为了纪念忒修斯的叔叔帕拉斯及其儿子们。忒修斯先把儿子阿卡玛斯和德摩丰送往攸俾阿，再企图镇压反对者。当他发现人心已变时，就放弃王位，离开了雅典。他在阿提喀的小镇伽尔盖托斯发表了对雅典人的诅咒，然后乘船前往斯库洛斯岛，那里有他的父亲留给他的大笔财产。
忒修斯上岛，向岛上的国王吕科墨德斯要求归还他父亲的遗产。这个国王也许是图财，也许与梅纳斯透斯有秘密协议，他带忒修斯去高处，说让他看一下他父亲从前的财产，乘忒修斯不备，把他推下了悬崖。
在雅典，梅纳斯透斯终于上台执政。忒修斯的儿子们作为普通士兵跟随英雄埃勒弗诺阿一起出征特洛伊。直到梅纳斯透斯死后，忒修斯的儿子们才执掌王杖。几百年后，雅典人为了把忒修斯迁回雅典，来到这个岛上发现，在他的坟墓里陪伴他的，只有一柄青铜剑和一杆大枪。雅典人举行盛大的仪式，把这个给予他们自由和宪法的人迎回去。
